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质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析 dna琼脂糖凝胶电泳实验步骤

网上有很多关于质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析的知识,也有很多人为大家解答关于dna琼脂糖凝胶电泳实验步骤的问题,今天小编为大家整理了关于这方面的知识,让我们一起来看下吧!

内容导航:

一、求助Real-Time PCR的详细步骤及注意事项?

二、试述 DNA 琼脂糖凝胶电泳开展的各项步骤中的注意事项有哪些

三、求分子克隆具体实验步骤一份~~多谢各位大侠啦~

四、质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析

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一、求助Real-Time PCR的详细步骤及注意事项?

实时荧光定量PCR技术是在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号实时监测整个PCR过程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。实时荧光定量PCR避免了传统PCR对最终产物检测和定量的偏差,提高了实验的可重复性。该技术已被广泛用于检测细胞mRNA表达的变化。比较不同组织中mRNA表达的差异。验证基因芯片和siRNA干涉的实验结果。主要实验步骤如下:

1.设计并合成RealtimePCR引物。

2.在引物溶解后,来自Promega的TaqDNA聚合酶用于优化含有SG(SYBR Green)的PCR反应。

3.样本的RNA提取a .实验对象是组织样本。取适量(50-100mg)新鲜组织样本或正确保存的组织样本,加入1ml RNA提取试剂Trizol(Invitrogen),匀浆后提取RNA。b .实验对象为细胞样本,每个样本取1 106 ~ 1 107个细胞。用PBS洗涤细胞,向PBS中加入1ml RNA提取试剂Trizol(Invitrogen),裂解后提取RNA。

4.RNA质量检测a .用紫外吸收法测定RNA在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,计算其浓度,评价RNA的纯度。b .用甲醛电泳试剂进行变性琼脂糖凝胶电泳,检测RNA的纯度和完整性。

5.使用逆转录酶(Promega)进行反应,将样品RNA逆转录成cDNA。

6.标准曲线样品的制备:相对定量需要用PCR扩增样品的目的基因和看家基因,产物用梯度稀释制作标准曲线。7.将标准曲线样品和待测样品分别加入到含有SG(其中TaqBeadTM热启动聚合酶来自Promega公司)的实时PCR反应液中进行实时PCR扩增和检测。8.通过标准曲线分析测试结果,以量化待测样品的目标基因。相对定量实验需要将样品的目的基因的测定值进一步除以管家基因的测定值来修正误差,得到的结果代表了样品的目的基因的相对含量。

二、试述 DNA 琼脂糖凝胶电泳开展的各项步骤中的注意事项有哪些

1)琼脂糖凝胶的制备:保证凝胶质地均匀,加样孔完整;EB剧毒,要一直戴手套。2)DNA样品的制备:在上样缓冲液中混入溴来自酚蓝的过程,作用温和,防止DNA的分子结构被破坏。3 360问答)加样流程:尽快加样,防止分子扩散;防止样品交叉污染,及时更换枪头。4)电泳过程:准备把握电泳时间,注意溴酚蓝带的位置。5)电泳结果分析:及时拍照,防止分子扩散;注意紫外线的危害,做好安全措施。

三、求分子克隆具体实验步骤一份~~多谢各位大侠啦~

分子克隆实验第一天:目的片段的扩增(PCR)PCR反应的基本成分包括模板DNA(待扩增的DNA)、引物、四种脱氧核苷酸(dNTPs)、DNA聚合酶和适当的缓冲液。PCR由三个基本反应步骤组成:变性-退火-延伸:模板DNA高温变性:模板DNA加热到94左右一定时间后,模板DNA的双链DNA或PCR扩增的双链DNA解离,从而可以与引物结合,为下一轮反应做准备;(2)模板DNA和引物的低温退火(复性):模板DNA加热变性成单链后,温度降至55左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;引物的适宜延伸温度:DNA模板-引物结合物。1.PCR(50ul)ddh2o 37.5 ul 10 buffer 5 ulm gcl 2(25 mmol)3 uld NTP(10 mmol)1 ul primer 1(10 mmol)1 ul primer 2(10 mmol)1 ul DNA 1 ULAQ 0.5 ul PCR反应条件:94 5min(94 30s。55 30.s . 7245s)x 30725min . 4或945min(9430s . 6430s . 7245s)X10(9430s . 6630s . 7245s)X10(9430s . 6838s)。注意:当待扩增的目的片段较大时,需要适当增加延伸时间(一般产物越长耗时越长:1分钟/1kb)。2.琼脂糖凝胶电泳检测:取5ul样品,5ul DNA上样缓冲液,混匀样品,150V恒压电泳20-30分钟,保存电泳图片。(琼脂糖凝胶的制备:将1xTAE缓冲液琼脂糖加热至琼脂糖完全溶解,然后冷却至60以下,加入EB混匀,倒板。其中琼脂糖含量为1g/100ml,EB含量为0.1ul/ml。)注:如果有异带侧,需要琼脂糖凝胶电泳回收目的片段。3.PCR产物的纯化:按照PCR产物回收试剂盒上的流程回收PCR产物,最后用45ddH2O洗脱,保存于-20供下次实验使用。4.PCR产物酶切(50ul) PCR纯化产物43UL10X缓冲液Tango 5ULE1 1ULE2 1UL酶切反应条件:37过夜反应或37反应3-4h。PCR产物的酶切和纯化:按照PCR产物回收试剂盒上的流程回收PCR产物,最后用25-30ddH2O洗脱,20保存或下次实验。琼脂糖凝胶电泳检测:将2-5ul样品的5ul DNA上样缓冲液混合上样,在150V恒压下电泳20-30分钟,保存电泳图片。以确保目标碎片被恢复。2.载体1的制备。质粒DNA的制备:用柱状质粒DNA的小试剂盒提取我们想要的载体质粒。2.质粒DNA 2UG 10X缓冲液Tango 10UL E1 2UL E2 2UL DDH2O用载体消化至100ul。反应条件:通用PGEX-4T在37水中浸泡3-4小时,pET系列在37水中浸泡过夜。3.琼脂糖凝胶电泳检测:取5ul DNA上样缓冲液样品5ul,混匀,150V恒压电泳20-30分钟。同时取未经酶切的约200ng质粒作为对照,保存电泳图片。(琼脂糖凝胶的制备:将1xTAE缓冲液琼脂糖加热至琼脂糖完全溶解,然后冷却至60以下,加入EB混匀,倒板。

其中琼脂糖含量为1g/100ml,EB含量为0.1l/ml。酶切产物的纯化:按照PCR产物回收试剂盒上的流程回收酶切产物,最后用20-30ul ddH2O -20洗脱,保存或下次实验。第二天。外源DNA片段在质粒载体1中的克隆。外源DNA片段与质粒载体的连接(10ul) DNA片段6ul载体2ul T4 DNA连接酶1ul Buf T4 DNA连接酶1ul反应条件:22水浴3-4h或16或4水浴过夜。通用片段:载体的摩尔比约为3:1,但这里我们通常用体积比。2.连接产物的转化:将所有连接产物加入体积不少于5-7倍的感受态细胞溶液中,冰浴20min,42热休克90s,然后静置,加入500-800ul(一般800)LB或SOB培养基,冰浴3-5min,37,200 RMP培养0.5-1h。4000rmp离心1分钟,弃去上清液,保留100-200ul混合菌沉淀,然后均匀涂布于抗性平板上。在37孵育过夜。质粒转化:在50-70ul感受态细胞溶液中加入1ul或50-100ng质粒,冰浴20分钟,42热休克90s,然后静置,在冰浴中加入500-800ul(一般800)LB或SOB培养基3-5分钟,37,200 RMP培养0.5-1小时。将100-200微升菌体均匀涂布在抗性平板上。在37孵育过夜。注:1。要区分质粒和连接产物的转化差异,不能想当然。2.根据实验要求选择所需的接受状态。阻力板的选择应根据所选择的载体和能力来确定。第三天,收集涂布的抗性平板以检查菌落生长,并保存在4下用于下一次实验;筛选鉴定或限制性酶切鉴定菌落PCR的筛选鉴定(25ul) DDH 2O 19.2 UL 10X缓冲液2.5 UL GCL 2(25 mmol)1.5 UL DNTP(10 mmol)0.5 UL引物1 (10mmol) 0.5 UL引物2 (10mmol) 0.5 UL AQ 0.3 UL模板作为单菌落PCR反应条件:94 5min(94 30s)。 55 30s.72 45s) x3072 5min.4或945min(9430s . 6430s . 7245s)X10(9430s . 6630s . 7245s)X10(9430s。5min.4保温注意事项:1一个项目一般要选5个单菌落进行菌落PCR。2以菌落为模板时,应事先准备好相应的抗性平板。选择带枪头的菌落时,应在事先准备好的相应平板上标明顺序,然后将枪头放入上述反应体系中搅拌。这个PCR的引物是通用引物,所以在原来的目的片段大小上加了100-200bp。琼脂糖凝胶电泳检测:取5ul样品,5ul DNA上样缓冲液,混匀,在150V恒压下电泳20-30分钟,保存电泳图片。根据菌落大小判断菌落是否正确。下班前,选择正确的细菌(在划线板上)接种于5ml具有相应抗性的LB培养基中,在37和200 RMP下过夜培养。

四、质粒DNA琼脂糖凝胶电泳图该怎么分析

一、实验名称:质粒DNA的提取和纯化,DNA琼脂糖凝胶电泳二、实验原理:1。质粒DNA的提取:质粒是一种双链、闭环的DNA分子,存在于细菌等几乎所有微生物的染色体(细胞质)外,能自主复制并稳定遗传,以超螺旋形式存在,是最常用的基因克隆载体。除质粒外,大肠杆菌还含有基因组DNA、各种RNA、蛋白质和脂质,因此需要裂解细胞,去除蛋白质和染色体DNA,分离纯化质粒DNA。分离制备质粒DNA的方法很多,其中常用的方法有碱裂解法、煮沸法、SDS法、羟基磷灰石层析法等。在实践中,可以根据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成和结构以及质粒DNA的用途进行选择。本实验采用碱裂解法,即用溶液、、分离提取质粒DNA。原理如下。(1)碱裂解法从大肠杆菌中提取质粒DNA的原理:碱裂解法提取质粒DNA是根据共价闭合的环状质粒DNA和线性染色体DNA变性和复性的不同来分离质粒DNA,从而达到分离纯化质粒DNA的目的。在pH高达12.6的碱性条件下,线性DNA由于氢键的断裂和双螺旋结构的解旋而变性。虽然共价闭合质粒DNA的大部分氢键会在这样的条件下断裂,但超螺旋共价闭合环的两条互补链是交织在一起的,不会完全分开。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液使pH恢复至中性时,共价闭合的环状质粒DNA复性,恢复其天然构象,并以可溶状态存在于液相中。而线性染色体DNA由于两个互补链相互完全分离,分子量大,结构复杂,所以相互缠结形成不可溶解的网络结构。它与不稳定的大分子RNA、变形蛋白质和细菌碎片一起沉淀和除去。用苯酚和氯仿变性蛋白质以除去蛋白质杂质,然后用无水乙醇沉淀以获得纯化的质粒DNA。溶液、溶液、溶液和无水乙醇沉淀DNA的具体作用和原理如下。(2)四种溶液作用及原理:溶液I的作用:悬浮大肠杆菌,增加溶液粘度,维持渗透压,防止DNA被机械剪切力降解。EDTA是二价金属离子如Ca2和Mg2的螯合剂。在溶液I中加入EDTA是为了螯合大肠杆菌细胞中的所有二价金属离子,从而抑制DNA被dnase降解,抑制微生物生长。此外,还能保证溶菌酶活性。溶液的作用:提供pH高达12.6的碱性条件,使大肠杆菌瞬间分裂,染色体DNA和质粒DNA变性。离子型表面活性剂十二烷基硫酸钠(SDS)能使细胞膜和核膜破裂,充分溶解膜蛋白。同时磺酸基团与蛋白质形成复合物并变形沉淀。溶液三的作用:是KAc-HAc缓冲液。溶液中所含的高浓度钾离子与溶液体系中的十二烷基磺酸钠反应生成十二烷基磺酸钾,使大部分结合的大肠杆菌蛋白和很长的基因组DNA一起沉淀并与质粒分离;另外,溶液III中含有的醋酸中和了溶液II的强碱性,使pH值呈中性,因为长期的碱性条件会中断DNA;基因组DNA一旦断裂,只要是50-100kb的片段,就没有办法被PDS共沉淀,所以会和质粒DNA共存。而且在质粒DNA的整个提取过程中,用无水乙醇在高盐低温条件下沉淀DNA,是通过化学或物理手段使基因组DNA分子和蛋白质变性,降低在体系中的溶解度,充分分离纯化实验所需的质粒DNA。

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标签:DNA质粒实验


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